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研究方向

单细胞与空间组学

致力于开发面向单细胞与空间组学数据的新型算法:(1)开发基于AI的单细胞空间组学数据整合挖掘算法,揭示跨尺度多维度分子信息;(2)构建脑组织的细胞时空图谱,精准鉴定细胞亚型,重构细胞间相互作用,解析细胞亚群在脑发育和脑疾病中的作用和机制;(3)与合作者发展单细胞空间组学测序新技术,推动神经科学研究和精准医疗的发展。

影像遗传学

基于自产和国内外主流公共数据平台的长短读基因组、代谢组、蛋白组、行为量表数据,依托张江国际脑库采集与收录的海量磁共振脑影像数据:(1)开发算法识别影像-遗传多模态脑疾病早期诊疗标记物、鉴定中国人群遗传风险特征;(2)探究脑疾病的遗传共性及其与衰老的关联;(3)发展基于AI的医学影像诊断模型、多模态新型治疗干预方法等

计算微生物组学

依托自产和公共数据平台的海量微生物基因组、代谢组等数据:(1)研发长短读段测序数据、多组学数据融合的宏基因组数据组装分析流程与新型算法;(2)识别微生物物种、鉴定新基因、新蛋白;(3)研发病毒-细菌相互作用预测方法;(4)开展微生物多组学与宿主疾病/行为/基因组关联分析及疾病分型等研究。