成员

个人简介：复旦大学生物医学工程与技术创新学院副研究员，博士生导师。2016年于清华大学获生物信息学博士学位，2017年于加州大学洛杉矶分校获统计学硕士学位，随后在耶鲁大学分子生物物理与生物化学系担任博士后，2021年初加入复旦大学。主要从事基因表达调控、单细胞空间组学以及发育、疾病的分子机制与转化研究。在Science、Cell、Nature Biotechnology、Nature Communications、Genome Biology、Cell Research、Nucleic Acids Research、Genome Medicine等期刊发表论文30余篇，谷歌学术引用5400余次。承担或参与了国家自然科学基金重点项目、科技部重点研发计划、上海市自然科学面上项目、上海市计算生物学领域项目、上海市市级科技重大专项等项目。以主要作者发表研究论文入选2021年度“中国生物信息学十大进展”。2022年入选上海市海外高层次人才项目。曾在DNA元件百科全书计划（ENCODE）、精神疾病大脑调控基因组联盟（PsychENCODE）、人类基因组注释项目（GENCODE）等多个国际基因组学大科学计划中担任研究员。

研究方向：计算基因组学和生物医学大数据的整合分析。目前研究兴趣为基因组调控元件与基因表达调控，以及与人类复杂疾病尤其是大脑相关疾病的关联。

代表性论文：

1. J Gong#, D Shao#, K Xu, Z Lu, ZJ Lu, YT Yang*, QC Zhang*. (2018) RISE: a database of RNA Interactome from Sequencing Experiments.Nucleic Acids Research46:D194-D201.

2. B Hu#, YT Yang#, Y Huang, Y Zhu, ZJ Lu. (2017) POSTAR: a platform for exploring post-transcriptional regulation coordinated by RNA-binding proteins.Nucleic Acids Research45:D104-D114.

3. Y Yang#, YT Yang#, J Yuan, ZJ Lu*, JJ Li*. (2017) Large-scale mapping of mammalian transcriptomes identifies conserved genes associated with different cell differentiation states.Nucleic Acids Research45:1657-1672.

4. YT Yang#, C Di#, B Hu#, M Zhou, Y Liu, N Song, Y Li, J Umetsu, ZJ Lu. (2015) CLIPdb: a CLIP-seq database for protein-RNA interactions.BMC Genomics16:51-58.

5. YT Yang, J Umetsu, ZJ Lu. (2014) Global signatures of protein binding on structured RNAs in Saccharomyces cerevisiae.Science China Life Sciences(Tsinghua Special Issue) 57:22-35.